中央主管機關就評鑑結果為優等者，給予下列方式獎勵：
一、核發獎牌，公開表揚。
二、計畫執行對農業有重大貢獻者，核發獎金。
三、列為次年度委託計畫之優先遴選對象。
四、由主管機關辦理業務觀摩。

直轄市、縣（市）主管機關自行辦理評鑑，得訂定獎勵措施。