本署設下列組、室、中心：
一、綜合規劃組，分三科辦事。
二、訓練發展組，分四科辦事。
三、就業服務組，分四科辦事。
四、身心障礙者及特定對象就業組，分四科辦事。
五、職能標準及技能檢定組，分三科辦事。
六、跨國勞動力管理組，分四科辦事。
七、秘書室，分二科辦事。
八、人事室。
九、政風室。
十、主計室，分二科辦事。
十一、資訊室。
十二、法務室。
十三、跨國勞動力事務中心，分四科辦事。
十四、勞動力發展創新中心，分二科辦事。