本條例所定縣（市）主管機關之主管事項如下：
一、縣（市）飲用水管理之實施方案與計畫之規劃及執行事項。
二、飲用水管理法規之執行與縣（市）飲用水管理規章之訂定、釋示及執行事項。
三、縣（市）飲用水管理之研究發展及宣導事項。
四、縣（市）飲用水水質之監測及檢驗事項。
五、執行飲用水管理調查及統計資料之製作及彙報事項。
六、縣（市）飲用水管理工作之推行及協調事項。
七、其他有關縣（市）飲用水管理事項。