空運管制權責，區分如下：
一、聯合運輸指揮部：負責空運作業運案之管制。依國軍各單位之空運申請，完成運量及運能之審查管制運用。
二、交通部民用航空局：負責民間空運作業、航空器整備及配合軍事運輸作業事宜。
三、空軍司令部：負責航空器（含已徵用之航空器、機具）調派支援與各軍用、民用機場軍事運輸之作業及機場設施之管制運用。戰時依軍事需求，對機場有優先使用權。