本局設下列組、室及稽徵所：
一、營所稅組，分十股辦事。
二、綜所遺贈稅組，分八股辦事。
三、銷售稅組，分七股辦事。
四、法務組，分六股辦事。
五、綜合行政組，分五股辦事。
六、徵收及資訊組，分九股辦事。
七、秘書室，分四股辦事。
八、人事室，分四股辦事。
九、政風室，分二股辦事。
十、主計室，分四股辦事。
十一、監察室，分二股辦事。
十二、北投稽徵所，分四股辦事。
十三、大同稽徵所，分四股辦事。
十四、中北稽徵所，分六股辦事。
十五、萬華稽徵所，分四股辦事。
十六、南港稽徵所，分四股辦事。
十七、文山稽徵所，分四股辦事。
十八、中南稽徵所，分六股辦事。
十九、士林稽徵所，分五股辦事。
二十、內湖稽徵所，分六股辦事。