第二大類藥品支付價格調整方式如下：
一、逾專利期第一年之藥品及其同分組品項，依下列方式調整價格：
（一）逾專利期藥品之支付價格，以下列方式取最低價調整：
（二）同分組藥品，以該逾專利期藥品之調整幅度等比例調整。無該逾專利期藥品者，以同分組品項加權平均銷售價格（GWAP）乘以一‧一五倍調整。但不得高於調整前之支付價格。
二、逾專利期次年起至第五年之藥品及其同分組品項，依下列方式調整價格：
（一）逾專利期藥品之支付價格以同分組品項加權平均銷售價格（GWAP）乘以一‧一五倍調整。但不得高於調整前之支付價格。
（二）同分組品項，以該逾專利期藥品之調整幅度等比例調整。無該逾專利期藥品者，以同分組品項加權平均銷售價格（GWAP）乘以一‧一五倍調整。但不得高於調整前之支付價格。
三、依前二款公式調整後，屬同藥品許可證持有者之品項，有低規格品項支付價格高於高規格品項支付價格之情形者，依前條第二款方式調整。
四、調整後之新支付價格，學名藥品不得高於原開發廠藥品。但具標準包裝及符合 PIC/S GMP，且其支付價格為基本價之藥品，不在此限。
五、保險醫事服務機構申報屬大包裝品項之最小單位，本保險藥品代碼末二碼為99者：以同藥品許可證各規格調整後最小單位之最低單價調整。