南院服務處掌理下列事項：
一、南部院區內公共事務營運、行政管理之規劃及執行。
二、南部院區生活服務設施之規劃及服務管理等事項。
三、院本部經管南部院區之研究（包括人文及社會研究基地暨圖書檔案室）、辦公、會議等空間管理。
四、南部院區公共設施之財產、物品、車輛、停車場及環境景觀等設施管理維護事項。
五、協助資訊服務處執行南部院區資訊網路系統之管理及維運等事項。
六、南部院區職業安全衛生、實驗室、廢棄物處理等公共安全管理事項。
七、院長交辦事項。