董事會之職權如下：
一、十年期國防科技發展構想與五年期國防科技研究、應用及產製計畫之審議。
二、年度營運（業務）目標及營運計畫之審議。
三、年度預算及決算報告之審議。
四、規章之審議。
五、自有不動產處分或設定負擔之審議。
六、院長之任免。
七、經費之籌募。
八、本條例所定應經董事會決議事項之審議。
九、其他重大事項之審議。