學校辦理本法第五十七條第三項規定事項，有下列情形之一，經本部查證屬實者，本部得變更或廢止原核定處分：
一、違反本法及相關法令。但依本辦法規定不受限制者，不在此限。
二、未依第四條核定之計畫執行，影響學生受教權益。
三、經私立學校諮詢會認有辦理不善之情形。

本部知有前項情形之虞者，應自知悉之日起進行查證，並應於二個月內完成查證，必要時得延長一次，最長不得逾二個月。