水翼船經特別檢查合格後，由航政機關憑檢查報告核發水翼客船或水翼非客船證書。

水翼客船證書、非客船證書之書式依附表規定。

水翼客船非領有水翼客船或水翼非客船證書，不得航行。各該證書有效期限屆滿時亦同。

水翼船非領有有效之水翼客船證書，不得搭載超過十二人之乘客。

水翼船證書之有效期限不得超過一年。水翼非客船證書之有效期限不得超過二年。

檢查人員在水翼船證書有效期間內，施行定期查驗合格後，應在證書上簽署並加註查驗日期及地點。

水翼船已逾定期查驗日期未申請查驗，或查驗不合格，其證書失效。

水翼船證書遺失、滅失、破損或證書記載事項變更時，船舶所有人應自發覺或發生之日起三十日內，向航政機關申請補發或換發。

水翼船證書換發時，應將原領證書繳銷。

水翼船證書申請補發或換發時，應依規定繳納證書費新臺幣五百元。