驗證機構有下列情形之一，經命其限期改正，屆期不改正者，得停止其全部或部分驗證業務；情節重大者，得廢止其認證：
一、未依食品衛生安全管理系統認證及驗證收費辦法規定，收取驗證費用。
二、未符合第三條或第六條第三項規定。
三、違反第七條第三款至第九款規定之一。
四、未依第十四條第三項自訂之期限，辦理食品業者之驗證。
五、違反本法或其他法律，經中央主管機關認定應停止執行驗證。