主任秘書承長官之命，處理事務，其權責如下：
一、本署文稿之綜核及代判。
二、機密與重要文件之處理及分配。
三、各種重要會議之籌劃及參加。
四、署長、副署長不在署時署務之代理。
五、分層負責權責範圍內事項之決定。
六、職責上應隨時提請署長、副署長注意之事項。
七、署長、副署長交辦事項。

組室主管承長官之命處理事務，其權責如下：
一、主管業務之籌劃及執行。
二、工作之分配、領導及監督。
三、文稿審核或代判。
四、主管業務報告之編擬。
五、各科工作與權責問題之協調及解決。
六、所屬人員派免、考核、獎懲之擬議及核轉。
七、年度工作計畫及預算之編擬。
八、關於職責上應隨時提請長官注意之事項。
九、其他交辦事項。

副組長襄助組長處理組務。

科長承長官之命處理科務，其權責如下：
一、主管業務之策劃推動及執行。
二、業務計畫及重要文稿之撰擬。
三、科務工作之分配及執行進度之查詢。
四、主管業務之聯繫協調。
五、主管文稿之初核。
六、所屬職員之指導監督及考核。
七、科務例行之處理及核簽。
八、其他交辦事項。

專門委員、秘書、技正、視察、專員、技士、科員、技佐、辦事員及書記，各承長官之命，處理業務。

本署處理事務，實施分層負責，逐級授權決定，其分層負責明細表另定之。

各級主管人員對於已授權之事項，得逕行決定或代行。

各科處理事務，意見不同時，由組室主管決定之；涉及其他組室職掌者，應會商辦理，各組室意見不同時，陳由署長、副署長核定之。

各級人員因事不能執行職務或請假時，應依規定指定或委託適當人員代理其職務，代理人就代理職務負其責任。