鐵路維護科掌理事項如下：
一、鐵路路線（含橋梁、隧道）檢查與維護計畫之提報、執行及管制。
二、路線災害修復工程、邊坡治理、建築工程與相關場站設施之維護及新建改善。
三、路線檢查、養護標準作業程序之擬訂、執行及管制。
四、路線養護人員之培育、訓練、督導及執行。
五、行車安全工作與路線巡查之執行及管制。
六、鐵路沿線林木巡查與環境綠美化之執行及管制。
七、鐵路維護機具、材料之研發、製作、檢查及廢料收回業務。
八、路線隔離封鎖與列車慢行之提報及管制。
九、其他有關鐵路維護事項。