資源永續利用司掌理事項如下：
一、農業水土林資源之統籌、協調及督導。
二、農業涉及政策環境影響評估之統籌及協調。
三、農地政策、國土計畫農業發展地區土地利用制度之規劃、研擬及協調。
四、農地資源盤查與農業跨部門空間發展策略（含農業綠能）之規劃、研擬及協調。
五、農業相關永續發展目標之統籌研擬、規劃及協調。
六、農業再生能源政策與空間發展之規劃、研擬及協調。
七、農業資源循環政策、法規之規劃、研擬及協調。
八、氣候變遷法規有關農業部門之盤查、報告、調適與溫室氣體減量政策之規劃及協調推動。
九、農業碳權與自然碳匯之統籌規劃及推動。
十、其他有關資源永續利用事項。