國內基因轉殖水產動植物移出實驗室前，或基因轉殖水產動植物自國外引進輸入前，應先向中央主管機關申請實施田間試驗。

國內基因轉殖水產動植物於實驗室或田間試驗階段，為研究交流目的展示者，應填具申請書並檢附下列文件向中央主管機關申請許可：
一、申請人國民身分證明文件影本一份；申請人為法人者，其登記證明文件及其代表人之國民身分證明文件影本各一份。
二、交流展示機構出具之邀請或合作同意文件。
三、展示計畫：包括展示之物種資料、基因轉殖來源、特性、功能機制、數量、地點、期間與管理人員簡歷冊及運輸路線、方式等相關說明資料。
四、安全防護計畫：包括展示期間、運輸過程之安全防護措施，發生逃逸、遭竊、物種雜交、大量感染疾病或天然災害等情形之緊急應變處理及通報主管機關流程等相關說明資料。

前項展示地點位於國外者，申請人應同時依基因轉殖水產動植物繁殖養殖管理規則第十六條第一項規定申請輸出許可。

田間試驗包含遺傳特性調查及生物安全評估二階段，其申請許可時點規定如下：
一、遺傳特性調查，應於完成實驗室試驗後或自國外引進前申請。
二、生物安全評估，應於完成遺傳特性調查並經審議通過後申請。

國外引進之基因轉殖水產動植物如已於輸出國完成遺傳特性調查者，得檢具證明文件，送中央主管機關審議通過後，直接申請生物安全評估。

基因轉殖觀賞魚之田間試驗，得向中央主管機關申請許可將第一項所定遺傳特性調查及生物安全評估合併執行。

申請許可為田間試驗，採個案申請，個案審查原則。

遺傳特性調查之申請，一案限提出一個具備明確編號之基因轉殖品種。該轉殖品種之受體水產動植物，以使用相同之外源基因及基因轉殖方法所獲得者為限。

生物安全評估之申請，一案限提出一個具備明確編號之基因轉殖品種。該轉殖品種係經遺傳特性調查所選出具穩定遺傳特性者，其編號需與遺傳特性調查試驗相符。

為因應基因轉殖水產動植物田間試驗期間可能之緊急危害及其安全管理，申請許可為田間試驗之同時，應將該基因轉殖水產動植物品種檢測所需之篩選標誌、相關方法及必要之檢測材料等資料，提交中央主管機關。

未依前項規定提交者，中央主管機關不予受理。