南方黑鮪作業漁船出港後，船長應每日透過電子漁獲回報系統回報所捕獲南方黑鮪每尾之體長、體重及標籤編號，並詳實且正確填寫主管機關指定之漁撈日誌；無漁獲者，亦應回報及填寫。

前項漁船所捕獲之南方黑鮪漁獲物，有下列情形之一者，應即丟棄，並將丟棄量填報於漁撈日誌及電子漁獲回報系統：
一、南方黑鮪配額用罄後，再捕獲南方黑鮪；其為季節性專業組且為印度洋大目鮪組者，並應離開作業漁區。
二、漁船為季節性專業組者，離開其作業漁區後，再捕獲南方黑鮪，不論當年度南方黑鮪配額是否用罄。