本部處理公務，第一層副審計長對審計長負責；第二層審計官、各單位主管對第一層負責，副主管對各該主管負責；第三層科長、組長、秘書對第二層負責；第四層股長、承辦人員對第三層負責。

各層負責人員奉准差、假不能執行職務時，應指定或委託適當人員代理，代理人就代理職務負其責任。<br />