國民法官個資保護委員會每四個月召開會議一次，必要時得召開臨時會議。以召集人為會議主席，召集人未能出席時，指定委員一名代理之。

國民法官個資保護委員會之相關行政事務，由司法院刑事廳及資訊處辦理之。