農田水利會之經費，以下列收入充之：
一、會費收入。
二、事業收入。
三、財務收入。
四、政府補助收入。
五、捐款及贈與收入。
六、其他依法令之收入。

前項各款收入免徵營業稅及所得稅。

農田水利會會費，應向享受灌溉或排水利益之會員徵收。

會員請求增加灌溉水量或抽水灌溉利益者，得按受益程度加收會費。

水利會會費，自應徵收之日起滿五年未經徵收者，不再徵收。但於五年期間屆滿前，已移送強制執行尚未結案者，不在此限。

前項水利會會費未恢復徵收前，由政府編列預算補助之。

農田水利會因實際需要，經主管機關核准或主管機關指定興建之農田水利工程，得向直接受益會員徵收工程費，自各該土地受益第二年起，分年徵收，以工程費總額為限。

受益土地變更用途時，未繳清之工程費，應由土地所有權人負擔之。受益土地所有權移轉時，應由承受人負擔之。

新會員入會或新建工程擴增受益之會員，應比例分擔工程費，作為特種基金，非經主管機關核准，不得動支。

農田水利會得徵收建造物使用費、餘水使用費，列為事業收入。

農田水利會依前四條規定徵收各費之適用對象、種類、徵收程序及其計算基準之辦法，由主管機關定之。

本通則規定之會費及工程費，繳納義務人逾期不繳納者，每逾三日加收滯納金百分之一，但滯納金加收累計不得超過百分之十。

前項會費及工程費逾三十日仍不繳納時，由各該農田水利會檢具催收證明，併同滯納金聲請法院裁定強制執行。不服裁定時，得提起抗告，但不得再抗告。法院之裁定，應於七日內為之。

農田水利會每年度之全部收入，除用人及管理上必需之費用外，應全部用於水利設施之興建、養護及改善，並酌提公積金、災害準備金及折舊準備金。

前項公積金、準備金，非經報主管機關核准，不得動用。

各農田水利會之經費，得由主管機關指定之金融機構代收經管。其所得之盈餘，應酌提百分之二十，作為農田水利會聯合會之輔導費用。

農田水利會每年度收入及支出，均應編制預算及決算。

前項各農田水利會預算、決算之編制及其他應遵行事項之辦法，由主管機關定之。

各農田水利會之會計制度應具有一致性；其會計報告、科目、憑證及內部審核程序，由主管機關定之。

農田水利會經費之保管、運用、財產處分及其他財務處理之辦法，由主管機關定之。