經濟部水利署為辦理臺北水源特定區土地建築管理、污水處理、水源保育治理及管理業務，特設臺北水源特定區管理分署（以下簡稱本分署）。

本分署掌理下列事項：
一、公共污水下水道系統之建設及維護。
二、年度計畫工程之興辦、設計、施工、監造及相關工務行政。
三、新店溪青潭自來水水質水量保護區水源保育及回饋費之業務推動。
四、臺北水源特定區計畫之建築管理。
五、其他有關保護臺北水源特定區水源水質水量管理事項。

本分署置分署長一人，職務列簡任第十一職等；副分署長一人，職務列簡任第十職等。

本分署置秘書，職務列薦任第八職等至第九職等。

本分署各職稱之官等職等及員額，另以編制表定之。

各職稱之官等職等，依職務列等表之規定。

本規程自中華民國一百十二年九月二十六日施行。