主任秘書承長官之命，處理事務，其權責如下：
一、本會文稿之綜核及代判。
二、機密與重要文件之處理及分配。
三、各種重要會議之籌劃及參加。
四、主任委員、副主任委員不在會時會務之代理。
五、分層負責權責範圍內事項之決定。
六、職責上應隨時提請主任委員、副主任委員注意之事項。
七、主任委員、副主任委員交辦事項。

技監承長官之命，處理事務，其權責如下：
一、農業重要技術案件之規劃及審議。
二、農業科技發展方案之審議。
三、農業關鍵性新技術引進及技術移轉作業之協調。
四、農業與學術界合作研究、委託研究案件之會核及協調。
五、提供農業科技研究發展之諮詢、服務及建議。
六、主任委員、副主任委員交辦事項。

參事承長官之命，處理事務，其權責如下：
一、法案命令之研議及審核。
二、計畫法案之研議及會核。
三、重要案件之審議及法令發布、修正、廢止文件之會核。
四、業務之研究改進與對重要政務之諮詢、服務及建議。
五、主任委員、副主任委員交辦事項。

處長、室、會、主管承長官之命處理事務，其權責如下：
一、主管業務之籌劃及執行。
二、工作之分配、領導及監督。
三、文稿之審核或代判。
四、主管業務報告之編擬。
五、各科工作與權責問題之協調及解決。
六、所屬人員之派免、考核、獎懲之擬議及核轉。
七、年度工作計畫及預算之編擬。
八、關於職責上應隨時提請長官注意之事項。
九、其他交辦事項。

本會處理事務，實施分層負責，逐級授權決定，其分層負責明細表另定之。

各級主管人員對於已授權之事項，得逕行決定或代行。

各科處理事務，意見不同時，由處室主管決定之；涉及其他處室職掌者，應會商辦理，各處室意見不同時，陳由主任委員、副主任委員核定之。

各級人員因事不能執行職務或請假時，應依規定指定或委託適當人員代理其職務，代理人就代理職務負其責任。