本辦法依植物防疫檢疫法（以下簡稱本法）第十三條規定訂定之。

依本法第十三條由直轄市、縣（市）主管機關負擔之補償費，因財政困難或有其他正當理由者，得報請中央主管機關補助二分之一為限。但疫情嚴重時，不以二分之一為限。

前條補助之植物或植物產品價格，不得超過直轄市、縣（市）政府辦理土地改良物徵收時，所定之植物補償費查估基準。

直轄市、縣（市）主管機關對依本法第十二條第一項之植物或植物產品之補償，於清除、銷燬完成後三十日內，檢具清除、銷燬紀錄、評價記錄及補償費金額，向中央主管機關申請補助。

本辦法自發布日施行。