本辦法依工廠管理輔導法（以下簡稱本法）第二十八條之十二第二項規定訂定之。

未登記工廠有下列情形之一者，得檢舉之：
一、中華民國一百零五年五月二十日以後新增之未登記工廠。
二、一百零五年五月十九日以前非屬低污染之既有未登記工廠，且未於直轄市、縣（市）主管機關所定輔導期限內，配合辦理轉型、遷廠或關廠。
三、一百零五年五月十九日以前低污染之既有未登記工廠，且未於一百十一年三月十九日前向直轄市、縣（市）主管機關申請納管。

檢舉前條未登記工廠應以書面、傳真或電子郵件記載下列事項，檢具證據資料，向該工廠所在地之直轄市、縣（市）主管機關檢舉：
一、檢舉人姓名或名稱、統一編號及聯絡方式。
二、疑有前條所列情形之一之未登記工廠廠名、廠址（位置）、負責人姓名及違法情節。但負責人姓名不明者，得免記載。

檢舉案經直轄市、縣（市）主管機關查證屬實者，直轄市、縣（市）主管機關應給予獎勵。但已聲明放棄者，不在此限。

前項獎勵方式，包括給予獎狀、獎牌、獎品或獎金。

二人以上聯名檢舉，或二人以上分別對同一案件檢舉者，應個別給予獎勵。

依本辦法給予之獎勵，經通知檢舉人領取，逾三個月未領取者視為放棄。

檢舉案有下列情形之一者，不予獎勵：
一、不屬第二條之檢舉對象。
二、檢舉人匿名或以不真實姓名檢舉。
三、檢舉案件查無具體事證或與檢舉事證不符。
四、檢舉案件於被檢舉前業經主管機關發現或處理在案。
五、已於網路、報章雜誌、廣播、電視、其他媒體所公開之檢舉案件。

第四條之獎勵，直轄市、縣（市）主管機關得每年辦理一次，並得依當年度檢舉人檢舉案之數量及重要性給予不同等級之獎勵。

直轄市、縣（市）主管機關對於檢舉人之姓名等足資辨識身分之資訊應予保密；有洩密者，應依個人資料保護法、刑法或其他法律處罰或懲處。

檢舉人之檢舉書及其他資料，除有必要外，不得附於調查案卷內，並應以密件保存，禁止第三人閱覽或抄錄。

依本辦法執行查核及獎勵所需經費，由直轄市、縣（市）主管機關編列預算支應。

本辦法自中華民國一百零九年三月二十日施行。