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化製場及化製原料運輸車消毒及查核辦法
成品農藥委託加工管理辦法
沒入農藥器械原料物品處理辦法
具繁殖力之檢疫物輸入風險評估作業辦法
指定動物傳染病檢驗及檢驗機構管理辦法
疫區植物或植物產品土壤及其包裝容器栽培介質遷移核准辦法
旅客及服務於車船航空器人員攜帶動植物檢疫物檢疫作業辦法
特定用途農藥申請審核辦法
特定物品檢疫物輸入核准辦法
特定植物檢疫物輸入核准辦法
偶蹄類動物進出澎湖地區檢查規則
動物及其產品進出金門馬祖地區檢查規則
動物用生物藥品查驗辦法
動物用藥品使用準則
動物用藥品委託製造管理辦法
動物用藥品許可查驗規費收費標準
動物用藥品販賣業管理辦法
動物用藥品新藥試驗辦法
動物用藥品管理法
動物用藥品管理法施行細則
動物用藥品製造業者輸入自用原料管理辦法
動物用藥品製造廠設廠標準
動物用藥品樣品試製及田間試驗管理辦法
動物用藥品優良製造準則
動物用藥品檢驗登記審查準則
動物用藥品檢驗標準
動物傳染病防治條例
動物傳染病防治條例施行細則
動物傳染病防治條例補償評價委員會之組成人員及評價標準
動物感染性生物材料管理辦法
動物醫事助理認證及認證機構認可辦法
動植物應施檢疫物進儲自由貿易港區檢疫作業辦法
動植物檢疫規費收費實施辦法
基因轉殖植物輸出入許可辦法
密閉式貨櫃運送動物產品輸入檢疫作業辦法
屠宰作業準則
屠宰場設置標準
屠宰衛生檢查收費標準
屠宰衛生檢查規則（89.04.19訂定）
梨接穗輸入檢疫作業辦法
清除豬瘟暨口蹄疫所需疫苗之種類及其管理辦法
鳥類輸出產地檢疫作業辦法
植物防疫及檢疫執行辦法
植物防疫檢疫法
植物防疫檢疫法施行細則
植物或植物產品運輸途中經由特定疫病蟲害疫區輸入檢疫作業辦法
植物疫病蟲害緊急防治補償費補助辦法
植物種苗疫病蟲害驗證規費收費標準
植物檢疫物違規輸入之情節輕微認定及減免處罰標準
植物檢疫物輸入隔離檢疫作業辦法
經郵寄方式輸出入植物檢疫物檢疫作業辦法
農藥工廠設廠標準
農藥代噴技術人員訓練辦法
農藥生產業及販賣業者評鑑獎勵辦法
農藥田間試驗準則
農藥使用及農產品農藥殘留抽驗辦法
農藥理化性及毒理試驗準則
農藥許可證申請及核發辦法
農藥販賣業個人資料檔案安全維護管理辦法
農藥運輸倉儲管理辦法
農藥管理人員訓練及管理辦法
農藥管理法
農藥管理法施行細則
農藥管理規費收費標準
農藥廣告申請審核辦法
農藥標示管理辦法
農藥標準規格準則
農藥檢查辦法
輸入動物用藥品樣品贈品管理辦法
輸入應施檢疫物追蹤檢疫執行辦法
輸入應施檢疫物檢疫準則
檢舉走私進口動植物及其產品獎勵辦法
檢舉或協助查緝禁用農藥偽農藥劣農藥獎勵辦法
檢舉動物用偽藥禁藥及劣藥獎勵辦法
繁殖用植物實施特定疫病蟲害檢查及收費辦法
獸醫師（佐）處方藥品販賣及使用管理辦法
獸醫師法
獸醫師法施行細則
獸醫師執業登記及繼續教育辦法