會長有下列情事之一者表揚之：
一、執行政府重大政策或經建計畫，圓滿完成，績效卓著者。
二、任期內，使會務推展順利圓滿，功績卓著，並連續三年業務考核甲等獲前三名者。
三、其他對農田水利事業有特殊貢獻，具體事蹟，足資表揚者。

農田水利會會長之考績，分年終考績、另予考績及專案考績，年終考績於每年年終辦理，專案考績於會長有一次記二大功、二大過時隨時辦理。

會長之考績，應以平時考核為依據，並按其工作及操行分別評分。其中工作分數占考績總分數百分之八十；操行分數占考績總分數百分之二十。

會長考績分數以一百分為滿分，其等次如下：
一、甲等：八十分以上者。
二、乙等：七十分以上不滿八十分。
三、丙等：六十分以上不滿七十分。
四、丁等：不滿六十分。

會長年終考績等次之獎懲如下：
一、甲等：晉薪一級，並給予一個月薪給總額之一次獎金；已晉至會長薪級最高級者，給予二個月薪給總額之一次獎金。
二、乙等：晉薪一級，並給予半個月薪給總額之一次獎金；已晉至會長薪級最高級者，給予一個半月薪給總額之一次獎金。
三、丙等：留原薪級。
四、丁等：免職。

會長任現職至年終滿六個月而未滿一年者，應另予考績，其獎懲如下：
一、甲等：給予一個月薪給總額之一次獎金。
二、乙等：給予半個月薪給總額之一次獎金。
三、丙等：不予獎勵。
四、丁等：免職。

會長平時考核及專案考績，分別依下列之規定：
一、平時考核：其獎勵分嘉獎、記功、記大功；懲處分申誡、記過、記大過。所得獎懲列入年終考績計算，平時考核獎懲得互相抵銷，其無獎勵可抵銷而累積達二大過者，其年終考績應列丁等。
二、專案考績：
（一）一次記二大功者，晉本薪一級，並給予一個月薪給總額之一次獎金，已晉至會長薪級最高級者，給予二個月薪給總額之一次獎金。
（二）一次記二大過者，免職。

年終考績結果自次年一月起執行；專案考績結果自專案核定之日起執行。

會長記大功、記大過依下列規定：
一、有下列情事之一者，記一大功：
（一）執行重要政令，克服危難，圓滿達成使命者。
（二）辦理重要業務，成績特優或有特殊績效者。
（三）搶救重大災害，切合機宜，有具體效果者。
（四）對於重大困難問題，提出有效方法，順利予以解決者。
（五）在惡劣環境下，盡力職務，圓滿達成任務者。
二、有下列情事之一者，記一大過：
（一）處理會務，存心刁難或蓄意苛擾，致損害農田水利會聲譽者。
（二）違反紀律或言行不檢，致損害農田水利會聲譽，或誣陷侮辱同事，事實確鑿者。
（三）故意曲解法令，致農田水利會、會員權利或利益遭受重大損害者。
（四）重大過失貽誤公務，導致不良後果者。
（五）有本通則第三十八條各款之一情節輕微者。

會長專案考績一次記二大功、二大過依下列規定：
一、有下列情事之一者，一次記二大功：
（一）針對時弊，研擬改進措施，經採行確有重大成效者。
（二）對會務提出重大革新具體方案，經採行確具成效者。
（三）察舉不法，維護農田水利會聲譽或權益，有卓越貢獻者。
（四）適時消弭意外事件或重大變故之發生或已發生而措置得宜，能予有效控制，免遭嚴重損害者。
（五）遇案情重大事件，不為利誘，不為勢劫，而秉持立場，為農田水利會增進榮譽，有具體事實者。
二、有下列情事之一者，一次記二大過：
（一）圖謀背叛國家，有確實證據者。
（二）執行政府政策不力，怠忽職責或洩漏職務上之機密，致農田水利會遭受重大損害者。
（三）違抗政府重大政令或嚴重損害政府信譽，有確實證據者。
（四）涉及貪污案件，其行政責任重大，有確實證據者。
（五）圖謀不法利益、言行不檢，致嚴重損害農田水利會聲譽者。
（六）侮辱、誣告或脅迫長官，情節重大者。
（七）挑撥離間或破壞紀律，情節重大者。
（八）有本通則第三十八條各款之一情節重大者。

會長之嘉獎、記功、申誡、記過標準，準用農田水利會員工獎懲基準之規定辦理。